MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC9

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017072	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080714
2	NC_017072	GGA	2	6	75	80	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080714
3	NC_017072	AGAGCG	2	12	122	133	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383080714
4	NC_017072	CAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080714
5	NC_017072	GGC	2	6	314	319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080714
6	NC_017072	AAAG	2	8	375	382	75 %	0 %	25 %	0 %	383080714
7	NC_017072	ACAAG	2	10	480	489	60 %	0 %	20 %	20 %	383080714
8	NC_017072	AAACG	2	10	568	577	60 %	0 %	20 %	20 %	383080714
9	NC_017072	AAGG	2	8	634	641	50 %	0 %	50 %	0 %	383080714
10	NC_017072	TGA	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080714
11	NC_017072	TGAAAG	2	12	794	805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383080714
12	NC_017072	AGC	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080714
13	NC_017072	CATA	2	8	849	856	50 %	25 %	0 %	25 %	383080714
14	NC_017072	TTA	2	6	866	871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080714
15	NC_017072	TGA	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080714
16	NC_017072	ACAA	2	8	956	963	75 %	0 %	0 %	25 %	383080714
17	NC_017072	AT	3	6	1017	1022	50 %	50 %	0 %	0 %	383080714
18	NC_017072	AT	3	6	1029	1034	50 %	50 %	0 %	0 %	383080714
19	NC_017072	AG	4	8	2029	2036	50 %	0 %	50 %	0 %	383080716
20	NC_017072	GCA	2	6	2132	2137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080716
21	NC_017072	CCA	2	6	2155	2160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080716
22	NC_017072	ATAC	2	8	2263	2270	50 %	25 %	0 %	25 %	383080717

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.